Yo tengo unas medidas básicas de protección:

1. Hace años Microsoft dijo claramente que windows no era apto para conectarse a internet sin un firewall por hardware de por medio.
2. No confiar en la seguridad de windows. Ningún antivirus, antispyware o anti nada son garantía. No se trata de si se infectará o no la máquina sino de cuánto tardará en hacerlo. Esto ocurrirá tarde o temprano.
3. Jamás tenga cosas importantes en su PC con windows. Debido a los virus puede perderlas, y debido a los spywares pueden robárselas.
4. Software a evitar: No use jamás MS Internet Explorer y Outlook. Si es imprescindible usarlo para alguna página en particular hágalo con mucho cuidado.
5. Los otros programas como Firefox (navegador) y Thunderbird (email) no son garantía absoluta de evitar virus y spywares. Sólo sirven para ganar tiempo, no se confíe.
6. De ser posible, instale Linux y si necesita windows córralo en una máquina virtual PERO:
   1. Una vez instalado su windows virtualizado haga una copia de seguridad de la imágen virtual. Téngala a mano para restaurarla en cuanto vea indicios de problemas. Haciendo esto tendrá todo solucionado en segundos.
   2. No use su windows virtual para navegar por internet. Es muy recomendable que la máquina virtual no tenga acceso a internet. Si necesita navegar hágalo desde Linux. Si necesita descargar software descárguelo desde Linux y acceda a él desde la máquina virtual por red.
   3. No guarde información en el disco de windows. Cualquier dato que tenga que manejar hágalo en el disco de Linux accediendo a él via red. De esta manera cuando windows se arruine y haya que restaurar la copia de seguridad, no se perderá nada.
   4. Es muy común que se use la máquina virtual como si fuera real, olvidándose de que hay disponible otro sistema mejor disponible. Use el windows exclusivamente para las cosas que sean imprescindibles (por ejemplo MS Office no es algo imprescindible). Open Office puede hacer la mayoría de las cosas igual o mejor, pero si es necesario es preferible instalar Office bajo Wine (o Crossover Office) directamente sobre Linux.
   5. Si usa Linux instale una versión nueva y manténgala actualizada. A diferencia de windows, en Linux las versiones más nuevas no necesariamente requieren equipos más poderosos o consumen más recursos. De hecho muchas veces ocurre lo contrario porque muchas veces las mejoras de una versión a otra se basan en optimizar los programas o limpiar código en lugar de incorporar mejoras estéticas o nuevas funcionalidades.